Lai maksājumu sistēmas raiti darbotos, nepieciešams pārraudzīt arī vērtspapīru norēķinu sistēmas, jo problēmas tajās var izraisīt maksājumu sistēmu darbības traucējumus un apgrūtinātu Eirosistēmas monetārās politikas īstenošanu. Vērtspapīru norēķinu sistēmas pārrauga nacionālās centrālās bankas.

Nasdaq CSD SE, kas Latvijā nodrošina vērtspapīru norēķinu sistēmas darbību, sāka darbu 2017.gada septembrī, apvienojoties trīs Baltijas valstu depozitārijiem un pievienojoties vienotajai Eirosistēmas vērtspapīru norēķinu platformai TARGET-2 VĒRTSPAPĪRIEM.
Latvijas Banka kopā ar pārējām Baltijas valstu centrālajām bankām pārraudzīja šo apvienošanās projektu triju gadu garumā (2015. – 2017.g.) un turpmāk veiks Nasdaq CSD SE sistēmas pārraudzību, vērtējot tās atbilstību starptautiskajiem pārraudzības principiem. Veicot sistēmu novērtējumus, pārraugi, ja nepieciešams, sadarbojas ar FKTK, kas uzrauga Nasdaq CSD SE darbību.
Nasdaq CSD SE izveidošana un tā pievienošanās TARGET2 vērtspapīriem vērtspapīru norēķinu platformai ir ieguvums Baltijai, jo pateicoties tam, investoriem un emitentiem ir vienota piekļuve Baltijas un Eiropas vērtspapīru tirgum, vienotai platformai un vienotām norēķinu procedūrām un tas viss kopā palielina Baltijas vērtspapīru tirgu konkurētspēju Eiropas Savienībā.
→ TARGET2 vērtspapīriem vērtspapīru norēķinu platforma